雇佣舰长是提升战斗力和资源获取效率的重要伙伴。增加雇佣舰长主要通过舰长招募系统实现，分为中级和高级两个卡池。中级卡池使用中级合同书招募，每日限购5次，最高可获得史诗品质舰长；高级卡池使用高级合同书招募，拥有保底机制，十连必出史诗舰长，百次必出传奇舰长。传奇舰长可驾驶T3科技等级舰船，是后期核心战力。除招募外，7日登录活动可免费获得1位史诗舰长，节日活动或特殊任务也可能提供高级合同书。
中级合同书可通过商贸区或军团商店购买，适合初期积累中坚力量；高级合同书获取难度较高，需通过每日特惠、克隆体维护或活动奖励逐步收集。由于中级卡池无保底机制，获取进攻型史诗舰长需一定运气，建议优先将资源投入高级卡池以稳定提升战力。低品质舰长虽属性较弱，但可用于悬赏任务或采矿，不应轻易退役。
舰长的职业分为军人、科学家、探险家和工程师，各自擅长不同领域。军人适合战斗援护，科学家加速科研，探险家提升采矿效率，工程师优化生产。派遣舰长执行悬赏或采矿任务可获取经验值，同时通过训练界面消耗记忆移植体快速升级。舰长等级受指挥官等级限制，需同步提升指挥官等级以解锁更高潜力。高品质舰长先天携带高级特长，后天特长可通过升级或特长芯片学习，建议优先培养传奇或史诗舰长。
若舰长培养方向不符需求，可通过退役返还经验值并保留1项后天特长。退役所得的记忆移植体和特长芯片可用于培养新舰长，形成资源循环。援护设置最多支持3名舰长，按优先级出战，建议将军人设为援护主力以平衡攻防。探险家驾驶工业舰时货仓容量影响采矿效率，需针对性强化相关特长。
